Cedro de São João är en kommun i Brasilien. Den ligger i delstaten Sergipe, i den östra delen av landet, 1,300 km nordost om huvudstaden Brasília. Antalet invånare är 5,633.
Omgivningarna runt Cedro de São João är huvudsakligen savann. Runt Cedro de São João är det ganska glesbefolkat, med 32 invånare per kvadratkilometer. Ett varmt stäppklimat råder i trakten. Årsmedeltemperaturen i trakten är 24 °C. Den varmaste månaden är januari, då medeltemperaturen är 28 °C, och den kallaste är juni, med 20 °C. Genomsnittlig årsnederbörd är 913 millimeter. Den regnigaste månaden är maj, med i genomsnitt 148 mm nederbörd, och den torraste är januari, med 15 mm nederbörd.
